Dans Killing Floor 2, les joueurs descendent en Europe où l'épidémie de Zeds s'est rapidement répandue et a gagné une élan irrépressible. Seulement un mois après la conclusion des événements du Killing Floor original, les clones sont partout et la civilisation est en désarroi ; les gouvernements se sont effondrés et les forces militaires ont disparu.

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